Formation R Studio et reproductibilité
Publié le 18 mai 2022
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Mis à jour le 17 juillet 2024
Date(s)
du 4 octobre 2024
au 21 octobre 2024
Dates : 4, 10 et 21 octobre 2024
Durée : 12h
Format : présentiel exclusivement
Lieux : salle A305, bâtiment René Rémond
Horaires : selon les séances
Nombre de participants maximum : 15
Public visé : tous doctorants
Nom des intervenant.e.s : Lauriane Rat-Fischer & Morvan Yannick
PRE-REQUIS OBLIGATOIRES :
Il est demandé aux participants :
- d’avoir quelques bases en statistiques descriptives/inférentielles
- de ramener leur propre ordinateur à chacune des séances afin de pouvoir pratiquer
- d’assister à chacune des trois séances (ne pas s’inscrire en cas d’absence prévue à l’une ou à plusieurs séances)
La formation se fait uniquement en présentiel
CONTEXTE DE LA FORMATION
La formation s’adresse aux doctorants qui souhaitent (ré-)apprendre à utiliser le logiciel R et R-Studio pour l'analyse de données statistiques. Elle implique dans un premier temps une introduction au logiciel (présentation, langage utilisé), sa prise en main (installation, configuration), l’exploration de données fournies par l’enseignant.e (statistiques descriptives et graphiques) et des exemples d'applications de tests de statistiques inférentielles (Chi-2, t-test, Anova). Dans un second temps, sera proposée une initiation à l’utilisation de R, Rstudio et Github comme outil de transparence et de reproductibilité de la recherche. Chaque leçon s’accompagnera de mise en pratique sur le logiciel.
OBJECTIFS
- Prendre en main le logiciel de statistiques R-Studio, explorer les données et savoir mettre en application des tests statistiques simples (Chi-2, t-tests, Anova)
- Relier Rstudio à un compte Github, utiliser RMarkdown pour l’écriture d’articles et l’analyse des données et enfin utiliser les outils de Git de R studio pour garder trace et mettre à jour son travail en le versionnant
OUTILS ET METHODOLOGIE PEDAGOGIQUE
- Support de cours fourni : diaporama, scripts et base de données fournis pour les exercices pratiques.
- Prérequis : avoir un ordinateur portable, avoir quelques notions de bases en statistiques inférentielles.
PROGRAMME
- Vendredi 4 octobre 13h-17h (Lauriane Rat-Fischer)
Introduction et prise en main du logiciel R et R-Studio.
Exploration des données.
Représentation graphique (partie 1)
- Jeudi 10 octobre 13h-17h (Lauriane Rat-Fischer)
Représentation graphique (partie 2).
Rappels de tests statistiques de base (Chi2, t-test, Anova) et mise en pratique
- Lundi 21 octobre 10h-12h – 13-15h (Yannick Morvan)
Partie pratique d’utilisation de Rstudio, Github & RMarkdown pour assurer transparence et reproductibilité dans l’écriture d’articles et l’analyse des données